超聲波DNA打斷儀采用等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合,用于無菌、可超微量破碎，隔著離心管能打斷染色體。專為二代測序DNA樣本與染色質(zhì)免疫共沉淀實驗樣本前處理量身訂做，對于每天要處理多個樣品或者貴重樣品的實驗室，它具有處理高通量，樣本低損耗，無交叉污染等優(yōu)勢。逐漸成為ChIP(染色質(zhì)免疫共沉淀)和DNA剪切研究平臺不可缺少的標(biāo)準(zhǔn)化工具。
工作原理
超聲波DNA打斷儀通過壓電轉(zhuǎn)換器，將電信號轉(zhuǎn)變?yōu)楦哳l聲波信號，產(chǎn)生數(shù)百萬的水分子”空穴”，利用“空穴” 在幾微秒內(nèi)變大、破裂產(chǎn)生的瞬時流體剪切力，通過等溫、非接觸的方式對樣品進行打斷、勻漿和混合。
應(yīng)用領(lǐng)域
• 高通量測序樣本前處理
• ChIP assay （染色質(zhì)免疫共沉淀）樣本前處理
• 超聲均質(zhì)、乳化制備為微懸浮液
• 貴重試劑超聲處理
產(chǎn)品特點
• 重復(fù)性好 可精準(zhǔn)控制樣本處理過程，實驗結(jié)果重復(fù)性高
• 樣本損耗小 最小可處理5µl，最大可處理2ml
• 處理效率高 樣本處理速度快，一次可處理6或12個樣本
• 片段范圍廣 100-1000bp
• 樣本零污染 非接觸式封閉破碎，最大程度降低污染風(fēng)險
• 適用范圍廣 不同樣本只需調(diào)節(jié)超聲參數(shù)，降低了實驗成本
• 等溫處理 可選配冷卻水循環(huán)系統(tǒng)，避免溫度過高對樣本造成損壞
超聲波DNA打斷儀優(yōu)勢
| 破碎方法 | 優(yōu)點 | 缺點 | |||
| 超聲波DNA打斷儀 | 操作簡單； 耗時短； 效率高； 安全性高； 無交叉污染； 樣本需求量少； 微流動現(xiàn)象和空化效應(yīng)均勻分布； |
影響片段大小的因素多，超聲體積、功率和時間等； | |||
| 酶切法 | 產(chǎn)率高； 樣本需求量少； 安全性高； 無交叉污染； |
存在序列偏好性； 耗時較長； 成本較高； 實驗條件要求嚴(yán)格； |
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| 化學(xué)法 | 對未經(jīng)克隆的DNA片段可以直接測序； 適合G或C含量較高的片段； 測序時5’和3’都可以標(biāo)記； |
操作繁瑣，費時費力； 化學(xué)試劑毒性大； 放射性同位素標(biāo)記效率偏低； |